有機肥生產設備主要是發酵部分和生產造粒部分。有機肥原料即便是發酵比較好，造粒也比較困難，因為有機原料的特點是原料粗糙，較輕，粘結率比較低。不同的有機原料都有不同的特點，因此選設備時，應特別慎重，不然不但會影響產量，而且造出的產品外表也達不到要求。
生物有機肥生產線包含的主要設備:
1.自動配料系統：自動配料系統主要由給料系統、稱重裝置、料倉、輸送皮帶組成。并且靜態配料系統同時具有動態配料的速度和普通靜態配料的精度（0.2%）。
2.新型有機肥造粒機：它采用濕法連續推桿造粒設計制造。此機不但可對多種有機物進行造粒，對使用常規設備難以成粒的粗纖維物料。
3.臥式攪拌機：該系列臥式混合機是我公司研制的混合設備，該機混合度高，殘留量少，適合于配合有機肥、無機肥的混合。
4.滾筒篩：該機采用了組合式篩網，便于維修與更換，其結構簡單、操作方便、運轉平穩，是復混肥生產中的理想設備。
5.輸送機：適用于煤炭、冶金、礦山、化工、建材、碼頭、倉庫、工地等輸送散狀物料或箱袋狀物品，適合在化肥廠、水泥廠等需要人工裝車的環境中使用，節省了大量人員。
6.烘干機：該機具有外形美觀，操作簡單、能耗低、壽命長、干燥均勻、維修方便等特點。
7.熱風爐：熱風爐鍋爐采用回水引射等技術，解決了鍋殼式鍋爐的管板裂紋、鍋筒下部鼓包、水冷壁爆管、熱效率低、出力不足，煤種適應性差等問題。
8.包裝秤：包裝秤主要由自動定量包裝秤（由儲料斗、喂料器，稱重夾袋斗，揉實機構，電腦控制，氣動執行部分等構成）與選配部分（輸送機、縫口機/熱合機）組成。
設備的選擇需注意的幾大關鍵因素：
發酵的方式、何種有機原料、機械化程度，年產量。有機肥內在品質做得好壞主要看發酵部分及產品的配方。發酵部分的關鍵因素有：微生物、碳氮比、碳磷比，水分，PH值、曝氣控制。如果一種因素控制不好就會產生不發酵，發酵不完全，或是發酵時間長的狀況。有機無機復合肥產品配方和無機肥一樣也要根據不同的土壤，不同的作物配方也有差別。如果發酵充分配方得當，效果比無機肥還好，造價低，并且做為綠色肥料，還能改良植物生存的環境和土壤的團粒化。
有機肥有養分含量高、副成分少且物理性狀好等優點，這些優勢對于提高肥料利用率，平衡施肥，促進作物的高產穩產有著關鍵性的作用。但它在不同土壤和不同作物所需的營養元素種類、數量和比例這樣多樣性的狀況下，養分比例還總是保持一樣。因此，使用前進行測土，了解田間土壤的質地和營養狀況，另外也要注意同單元肥料配合施用，才能使其發揮效果。
